macOS Big Surにしたらアプリ「Skitch」でキャプチャすると、ウィンドウをすり抜けて指定の箇所の背景側(壁紙)だけがキャプチャされるようにになってしまったため、その解決方法を解説します。
「セキュリティとプライバシー」から設定を許可する
要因はセキュリティによるもので、「システム環境設定」を起動して「セキュリティとプライバシー」を選択すると一覧が表示されます。
その中から「画面収録」を選ぶとSkitchがあるので、カギアイコンをクリックして解除します。
解除したらチェックを入れて、またカギアイコンをクリックしてロックをかければ完了。
これで本来の指定した箇所がキャプチャできるようになります。
追記:macOS Big Sur 11.4にアップデートすると追加の設定が必要になります。